مطالعه ژن ها و مناطق كروموزومی شناسایی شده مسئول برای صفات عملكردی و تولید مثلی در گوسفند: فراتحلیل پویش كل ژنوم
تاریخ دفاع
مقطع تحصیلی
كارشناسی ارشد
گروه آموزشی
علوم دامی
استاد
سعید انصاری مهیاری
به منظور بررسی ژن¬ها و مناطق کروموزومی شناسایی شده مسئول صفات عملکرد تولید مثلی در گوسفند، مطالعه¬ فراتحلیلی پویش کل ژنوم انجام شد. بدین منظور با استفاده از کلید واژه¬های فارسی و معادل لاتین آن¬ها از جمله ژن، کروموزوم، ، GWAS، مناطق کروموزمی، گوسفند، صفات عملکردی و صفات تولید مثلی در پایگاه¬های انگلیسی زبانی PubMed، Scopus، Web of Science و Google Scholar و فارسی زبان Irandoc، SID، Magiran و Civilica مقالات مورد نظر استخراج و سپس وارد نرم افزار اندنوت گردید. پس از حذف مقالات تکراری و مقالات فاقد اطلاعات مورد نظر، در نهایت 35 مطالعه وارد نرم افزار R نسخه 1.4.4 گردید. به منظور تجزیه و تحلیل داده¬های به دست آمده از بسته metafor و qqman استفاده شد. نمودار صفات گروه وزن در این مطالعه نشان داد که بیشترین تعداد اسنیپ ابتدا بر روی کروموزوم 6 و بعد از آن کروموزوم X و بعد از آن بر روی کروموزوم 3 قرار دارد و کمترین اسنیپ¬های مشاهده شده بر روی کروموزوم 24 است. نمودار صفات گروه تولید مثل نشان داد که بیشترین تعداد اسنیپ ابتدا بر روی کروموزوم 1 و بعد از آن کروموزوم 2 و 3 قرار دارد. همچنین کمترین تعداد اسنیپ در این گروه بر روی کروموزوم 16 قرار داشت. بیشترین تعداد اسنیپ¬ها برای صفات گروه شیردهی ابتدا بر روی کروموزوم 2 و سپس شماره 1 و بعد از آن شماره 3 قرار دارد. همچنین کمترین تعداد اسنیپ¬ها بر روی کروموزوم 23 مشاهده گردید. نتایج مربوط به منهتن پلات برای صفت وزن تولد چهار اسنیپ OAR2_51716542.1، OAR12_20575087.1 ،OAR17_29260298.1 و s03219.1 را معنی¬دار نشان دادند که به ترتیب بر روی کروموزوم¬های 2، 12، 17و18 قرار داشت. برای صفت وزن از شیرگیری دو اسنیپ rs421690996 و rs409558668 که به ترتیب بر روی کروموزوم¬های 22 و 16 قرار داشتند معنی¬دار مشاهده گردیدند. برای صفت افزایش وزن روزانه قبل از شیرگیری اسنیپ OAR10_91128145.1 که بر روی کرموزوم 10 قرار داشت معنی¬دار اما برای افزایش وزن روزانه پس از شیرگیری اسنیپ معنی¬داری مشاهده نگردید. برای صفت افزایش وزن روزانه و وزن صفت بدن اسنیپ rs414911966 و s45224.1 که به ترتیب بر روی کروموزوم 20 و 1 قرار داشتند معنی¬دار مشاهده گردید. همچنین برای وزن یک¬سالگی اسنیپ¬های OAR6_27552838.1، OAR8_39977285.1، OAR5_84496122_X.1، oar3_OAR9_42035112، oar3_OAR20_22070146 و s12060.1 که بر روی کروموزوم¬های 6، 8، 5، 9، 20 و1 قرار داشتند معنی¬دار مشاهده گردیدند. برای صفت تولید مثلی اندازه بره متولد شده اسنیپ s50067.1 واقع بر روی کروموزوم 2 و برای صفت دو قلوزایی اسنیپ OAR3_233748114.1 واقع بر روی کروموزوم 3 معنی¬دار شد. برای صفات تولید و ترکیبات شیر از جمله درصد پروتئین و مقدار چربی اسنیپ معنی داری مشاهده نشد اما برای صفت درصد چربی دو اسنیپ rs425417915 و OAR3_147028849 که به ترتیب بر روی کروموزوم¬های 7 و 3 واقع قرار داشتند معنی¬دار بودند.
کلمات کلیدی: ژن، کروموزوم، شیر، وزن بدن، تولید مثل، افزایش وزن بدن

